《名山藏》是其代表性著作之一，其体例之规整、史料取舍之精审、文字表述之生动，历来为后世史家所称赞。《名山藏》的丰富内容，其中保存了明代大量不见于其他史书记载的珍贵史料，具有极其重要的文献史料价值。
何乔远（1558-1632），字稚孝，或称穉孝，号匪莪，晚号镜山。福建晋江人。少即聪颖好学，在父亲的亲自教诲下，博通经史子集，《文选》，《唐诗》过目成诵。明万历四年（1576），与兄乔迁同登乡榜举人。其后十年，闲居家乡，与兄迁、杨文恪(杨道宾)、陈及卿、李世祯、山人黄克晦结社赋诗,时有“温陵五子”之称。万历十四年（1586），登进士第。十八年（1590）四月，首授刑部云南司主事。
万历二十年（1592），日本军队入侵朝鲜，二十一年（1593），提督李如松率军入朝作战，先胜后败，战局陷入焦灼。兵部尚书石星主停战，议请对日封贡。何乔远当即据实上书，反对兵部的封贡建议，并条陈历朝驭倭策略，力主继续用兵朝鲜，制止日军侵略。神宗览此疏亦颇心动，后终因石星坚持己见，何乔远的主张未能被接受。然而，封贡事败，日军再度入侵，朝鲜战火重燃，众人始服其远见。是年（1593），神宗欲封皇长子为王，何乔远上疏力谏。后赵南星被斥，陈泰来等人受降职处分，何乔远又上书极言不可。二十四年（1596），何乔远因属吏誊写宗室分封文书时校对不精，遗漏了衔名，坐“奏牍不恭”之罪，贬谪广西布政司经历。次年（1597），妻子病故，乃告假归乡治丧，从此绝意仕进，居家二十年，倾力于史学创作与地方的教育事业。
历四十年（1612），何乔远敦请郡守蔡继善重修一峰书院，并延请郑孩如、唐见梅、韦衷芹等名师来书院讲学。又于镜山下购置农舍数间，创设“休山书院”。四十八年（1620），光宗即位仅八日后，即迅速起用何乔远，任命其为光禄少卿。
天启元年（1621）四月，女真入侵，沈阳、辽阳均陷落，辽东局势危殆。时王世贞为辽东巡抚，驻守广宁，力主出战，收复失地，时任首辅的叶向高亦同此议。惟何乔远独言：
“阃外固有不御之权，庙堂亦有制胜之策。今辽东之役费金银千百万，会有越三岔河一步者乎？民既涣散，士复愞懦，折箭埋沙，凿毙马眷，刍豆之费，取以糊口，以此人心，但可导使之守，岂可使战哉！轻战必至丧地，力守便可完城。地失而城亦失，城存而地亦存矣！”（《明熹宗实录》卷十六）并献守御对策，众人皆以为迂，后广宁果不守，辽东随失。
天启二年（1622）九月，因给事中朱童蒙、郭允厚、郭兴治三人弹劾何乔远醵金讲学之事，遂被迫辞职归乡。崇祯二年（1629），何乔远再受起用，任南京工部右侍郎。他上任伊始，即上疏崇祯皇帝，建议开通镇江南湖以连接内河运输。
崇祯皇帝览表后大喜，“嘉其老成体国，署户、工二部”（李清馥《闽中理学渊源考》卷七十五《司徒何镜山先生乔远》）。任职两个月后，主动引退。临行，复上《请开海禁》一疏，请求开放海禁以弭盗安民。四年（1631），何乔远病卒，享年74岁。
何乔远一生博闻广识，著述甚丰，除《名山藏》外，还有《闽书》一五四卷、《镜山全集》七十二卷附五卷、《皇明文徵》七十四卷，均有崇祯间刻本。另据查继佐《罪惟录》记载，何乔远还著有《编年录》《四朝集》《征西集》《狱志》《膳志》等书，但刊行情况不详。
《名山藏》一百九卷，具体的写作过程与成书时间，史无明载。但结合何乔远的生平经历，大致可以追溯至其任职刑部云南司主事期间。当时，他作为一名新进进士，地位低微，工作清闲，便利用职务之便，于政务之暇，遍览有明历朝实录与稗官野史家乘，辑成一书，也就是后来《名山藏》一书的底本。
至于该书的真正成书时间，天启三年，当时出任礼部尚书的朱国祯曾抄录过《名山藏》，可见《名山藏》成书当在天启之前，也就是何乔远去官居家的二十年间，他利用任职刑部期间所编成的初稿，经过数十年的增删修订，最终成书。
《名山藏》是一部典型的纪传体类史书，但与一般纪传体史书的体例又有所不同，明目上并无传统的“纪”“传”“表”、“志”的分别，而是将全书分为三十七记，也即三十七个专题，分类叙述史实。
首有钱谦益《序》、李建泰《序》、王邵《序》。卷一至卷二十九，《典谟记》；卷三十至卷四十五分别为《坤则记》《开圣记》《继体记》《分藩记》《勋封记》《天因记》和《天敺记》；卷四十六至卷五十五，《舆地记》《刑法记》《河漕记》《漕运记》《钱法记》《兵制记》《马政记》《茶马记》《盐法记》；卷五十六至卷一百九，《臣林记》《臣林外记》《臣林杂记》《关柝记》《儒林记》《文苑记》《俘贤记》《宦者记》《宦者杂记》《列女记》《高道记》《本士记》《本行记》《艺妙记》《货殖记》《方技记》《方外记》《王亨记》。
由于其标目奇特，含义费解，为便于读者理解，以下简要介绍各记之内容。其中：
《典谟记》以编年的方式记载嘉靖以前明历代帝王之事，类似于正史之“纪”。《坤则记》，记载马皇后以来二十位皇妃的事迹；《开圣记》记载朱元璋即位后所追封的五位先祖的事迹；《继体记》记载那些未能登上皇位的短命太子的事迹，其中也包括建文帝、景泰帝所册封的两位太子；《分藩记》记载历代分封于各地的藩王之事；《勋封记》记载历年受封的功勋大臣之事迹；《天因记》记载与朱元璋有共同起兵的郭子兴、韩灵儿的事迹；《天敺记》，记载元末与朱元璋争雄天下的陈友谅、张士诚、方国珍、明玉珍、陈有定、扩廓帖木儿的事迹。
《舆地记》《刑法记》《河漕记》《漕运记》《钱法记》《兵制记》《马政记》《茶马记》《盐法记》等，记述了明代各种典章制度及社会、地理、经济、军事等情况。
如：《舆地记》记载南京与北京的地理状况，包括历史沿革与行政区划等，同时还将军事部署等内容附列其中，实现了“地理志”与“兵志”合而为一；
《刑法记》则叙述了明代刑法制度，基本收录了《明大诰》；
《河漕记》主要记载了明代几条主要河流及其治理过程；
《漕运记》载及明代漕运制度；
《钱法记》主要记录了明代钱币铸造及流通情况；
《兵制记》记载明代的军事制度，包括各军事机构的职能、名称变迁、人员组成以及士兵的训练、考核、奖惩机制；
《马政记》记录明代马政事业，包括马匹数量及其繁育、喂养和服役情况。
《茶马记》叙述明代茶马贸易情况；《盐法记》记载明代的官盐制度。类似于正史的“志”。
《臣林记》以时间为顺序，分别介绍洪武至隆庆历朝正直大臣的事迹；
《臣林外记》则记述建文一朝殉节臣子的事迹；
《臣林杂记》，记录历代奸佞大臣之事；《关柝记》记载那些为民请命、直言进谏的官员的事迹；
《儒林记》和《文苑记》记载明代在思想文化领域有突出贡献的人士如王守仁、王世贞等人的事迹；
《俘贤记》记载为《元史》未收而又为朱元璋嘉奖过的蔡子英、伯中、简祖英三人事迹；
《宦者记》记载郑和等有贡献的宦官；《宦者杂记》则记载权宦事迹；
《烈女记》记录明代贞洁烈女之事迹；《本士记》记载品行高洁君子的事迹；《本行记》记载是那些行为道德高尚的平民的事迹；
《艺妙记》记载明代艺术家沈度、黄子久等人的事迹；
《货殖记》记载明代七位江南大商人之事；
《方技记》则记载从事卜筮、相面、医药等行业者的事迹；
《方外记》记叙僧人、道士之事迹；
《王亨记》记明朝周边国家或地区的情况。
《臣林记》以下各记，类似于正史之“传” ，是全书的主体部分。
《名山藏》是何乔远以当代人写当代史，故其内容丰富，保存了大量明代的珍贵史料，其中的许多史料不见于其他史书，对于了解明代历史具有十分重要的史料价值。尤值一提的是，书中对明代周边的国家与地区做了较为详细的介绍，有关海外诸国的记载主要体现在《王享记》中，历来为学者所重。
《王享记》所载包括：“东南夷”“北狄”“东北夷”“西戎”。 “东南夷”分三篇，首篇记载的是朝鲜、日本，第二篇为琉球、安南、真腊、暹逻，第三篇则记载了占城、爪哇等50多个国家和地区的情况。“北狄”包括鞑靼、兀良哈；“东北夷”则是海西、建州；“西戎”记载了哈密、火州、吐鲁番等西域地区的概况。
均比较详细地记录了中国和上述国家或地区间的贡使往来以及经济文化的交流。在“琉球”一节中，作者详细记载明太祖朱元璋特赐闽人三十六姓移居琉球，推动琉球经济文化大发展的过程。这是了解琉球历史发展及其与中国的经济文化交流的重要资料。
除琉球以外，明代中国与东南亚地区各国也有着频繁的经济文化交往，《王享记》在这方面也有诸多记载。这些记载对研究明代中国和东南亚的经济文化交流史具有极为重要的史料价值。如永乐年间，东南亚地区的苏禄、勃泥、古麻刺、满刺加四国的国王曾先后率众来华，其中有三位国王不幸在华逝世。《王享记》中就分别记载了有关史实和葬地等情况。
除了记载海外各国的情形外，《名山藏》也保存了不少福建地方史的宝贵资料。如泉州有所谓“三贤”“四贤”墓，是唐代来泉州传播伊斯兰教的两位圣门弟子的坟墓，现在已是我国重点文物保护单位。有关阿拉伯伊斯兰教徒的的史料来华在历史文献中的记载很少，而在何乔远的《名山藏》中对此却记载得颇为详细。《名山藏·王享记》云：
默德那与天方接壤，回回祖国也。城池宫室，田园市肆，大类江淮间；寒暑应候，民物繁庶，有阴阳星历，医药、音乐诸技艺……隋开皇中，其教始入中国，教以天为本。宣德中，国王遣使随天方使来朝贡，而今中华回回种所在有之。
这里所谈到的阿拉伯伊斯兰教徒来到中国，与史书中所说的唐代伊斯兰教的四大贤人中的“三贤”“四贤”来泉州传教，最终葬于泉州的史料，可以互相印证。
《名山藏》也很重视市井小民的事迹。何乔远为官时间不长，他生命中的大部分时间都身处民间。在《名山藏·本行记》的《小序》中说：
陋巷耕凿傭贩之徒，吾尤重之。天下大矣，生于偏州僻邑，当不绝人，无有文字为之记，则其故老乡人一时道说，久无闻矣，吾尤悲焉。盖士大夫只十之一，小民闾巷十之九。
可见《名山藏》中所记载的平民百姓的事迹许多都来自于何乔远的亲身闻见，这正是一般正史中所难以见到的第一手的宝贵资料。
《名山藏》初刻于明崇祯十三年（1640）。由于大量叙及女真旧事，该书在清代多次被禁毁，流传不广。北京大学图书馆根据其所藏《名山藏》一百七卷本，并参照中国社科院历史所等单位藏本整理，1993年8月由北京大学出版社影印出版。福建省文史研究馆则根据山西省祁县图书馆藏《名山藏》一百九卷本,并参补福建师范大学图书馆藏本、南京图书馆藏本整理，1993年11月由江苏广陵古籍刻印社印出版。另有张德信、商传、王熹以北京图书馆藏本点校的《名山藏》,福建人民出版社2010年出版，颇便读者阅读。
另外，《闽书》一百五十四卷，亦是何乔远的代表著作之一。该书编纂于明万历四十年（1612），荟萃福建郡邑各县志等地方文献，参考前代载记，编纂而成。首有熊文灿《序》、郑之玄《序》、叶向高《序》以及“凡例”。全书分二十二门，曰：“分野》、方域、建置 、风俗、版籍、捍圉、前帝、君长、文莅、武军、英旧、方技、宦寺、方外、闺閤、、岛夷、灵祀、祥异、萑苇、南产、蓄德、我私”。
《四库全书总目》评该书曰：
其标目诡异，多乖志例。《扞圉志》载兵防及将弁兵士额数，而复有《武军志》以详其人。《文莅志》则合职官、名宦而为一，分并均失其当。《前帝志》载宋端宗及少帝昺，端宗虽即位於福州，然正史已详，不宜复入志中。且帝昺即位於粤之碙洲，尤与闽无涉。《英旧志》载人物，而复分《缙绅》《弁韐》《关柝》《韦布》《闾巷》《侨寓》《裔派》为七类，转觉淆杂。《宦寺志》专载五代林延遇，明张敏、萧敬三人，亦非志中所应有。《蓄德志》杂载丛谈逸事，并及诗话文评，於名为不称。《我私志》则乔远自志其宗族，虽仿古人自叙之例，而称名不典，语多鄙野。其文辞亦好刊削，字句往往不可句读。盖不能出明人纤佻矫饰之习。
然而，目前学术界则普遍认为，该书是一部系统记录研究我国东南沿海地区政治、经济、氏族、民风、民俗等文化的重要著作。正因为作者生活于普通民众之间，故书中文辞颇异千古学究清高不群之古风，广泛采纳了寻常百姓、市井众生的朴实本土语言，深为民众所欢迎。实际上，该书的确保存了明代以前许多罕见而珍贵的史料。
诸如：蒲寿庚、伊斯兰教“四贤”来华传教及摩尼教传入中国等等史事的记载，均对中外交通史、世界宗教史及其它研究领域，有着其它文献所不可替代的文献参考价值。该书传世主要有：明崇祯二年（1629）刊本。1994年，福建人民出版社出版了厦门大学古籍整理研究所历史系古籍整理研究室《闽书》校点组校点的《闽书》，颇便读者阅读。
来源：福建省炎黄文化研究会
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